Рівень циркулюючих запальних білків залежить від генетичних варіацій, при цьому матрична металопротеїназа-10 (MMP-10) має найсильніший зв'язок із запаленням типу II та астмою.
Масштабне шведське дослідження, опубліковане в журналі Allergy, вивчило, як генетична варіабельність впливає на рівні запальних білків у крові. Було отримано нові біологічні дані про патогенетичні механізми бронхіальної астми та запалення другого типу.
Дослідники взяли дані когорти BAMSE (Barn, Astma, Miljö, Stockholm, Epidemiologi, у перекладі - «Діти, астма, довкілля, Стокгольм, епідеміологія») і проаналізували 92 білки плазми, пов'язані з запаленням, у 1538 молодих пацієнтів за допомогою методу картування локусів білків кількісних ознак (pQTL). За результатами дослідження було виявлено 45 сигнальних pQTL (33 цис- і 12 транс-локусов), з високою статистичною значущістю, що впливає на 39 різних білків (p ≤ 7,14 × 10⁻¹¹). Значна частина цих асоціацій була успішно відтворена в незалежних наборах даних, що підтверджує достовірність отриманих результатів.
Для уточнення регуляторного контексту дослідники використали публічно доступні дані, щоб зіставити виявлені pQTL з локусами, що впливають на експресію генів (eQTL). Було виявлено високий ступінь колокалізації для 19 білків у різних тканинах, що свідчить про те, що одні й ті ж генетичні варіанти можуть одночасно визначати рівень експресії генів і концентрацію відповідного білка в плазмі. Клінічну значущість цих білків додатково дослідили шляхом перевірки їхнього зв'язку з ознаками астми та запаленням 2 типу, зокрема підвищеним рівнем оксиду азоту у видиханому повітрі, підвищеним рівнем еозинофілів крові та сенсибілізацією до вдиханих алергенів.
6 із 39 досліджений білків із дійсними pQTL були пов'язані з цими ознаками захворювання. Серед них найсильніший і найстабільніший кореляційний зв'язок було виявлено для матричної металопротеїнази-10 (MMP-10), що вказує на її можливу ключову роль у підвищенні запалення дихальних шляхів у пацієнтів з астмою з тяжкими імунними реакціями типу ІІ. Результати вказують, що генетична варіабельність є одним із ключових чинників циркуляційного рівня запального білка. Ці знання можуть сприяти пошуку біомаркерів і терапевтичних цілей при астмі, особливо у пацієнтів із запаленням 2 типу, варіанти лікування яких наразі обмежені.
Allergy
Genetically Determined Inflammation-Related Proteins in Asthma and Type-2 Signatures
Natalia Hernandez-Pacheco та ін.
Коментарі (0)